寺院占地68畝。凈慧寺相傳原是三國時期周瑜水軍行轅,南朝義將儲福路經(jīng)此處,因觀其地瀕萬傾太湖,地勢軒敞,包孕吳越,遂改建成寺,距今已有一千四百多年歷史。
最先引人注意的是樹在前面的兩塊高高的長方形石條,仔細看原來是用來樹旗桿的,上面隱約刻著文字和圖案,但已模糊看不清了。在南面有一水潭,因為西面一座小橋,所以不知原來是河還是廟前的水池。在潭邊有幾塊很大的石頭,從殘留的石刻知道這是寺廟從前建筑的遺跡,想當年它們會是多么氣勢雄偉,如今只能靜靜地躺著與倒在這里的香灰相伴,前面還有兩座石塔,是后人新刻的,不知從它們身上能否看到那殘石的影子。邊上還有一塊石頭,從不同的角度看像豬、像魚、像獸……也許稱得上是寺廟的一個寶貝了。
據(jù)史載:大宋紹定年間,香火盛期,有僧侶三百余眾,寺田五百余畝。明朝朱元璋軍師劉伯溫到凈慧寺,有香花橋上度六步,河水倒轉向西流之傳說。如今寺內(nèi)還保留有老營橋、六步橋、兵工橋,寺內(nèi)有將軍墓、雙塔蓮花石幢、和尚墳、旗桿石、古桂花樹等古跡村名。
清乾隆皇帝到常州指定要游凈慧寺,因一時無法修通道路,無錫官員將凈慧寺匾額移到無錫崇安寺,乾隆御賜赦重建凈慧寺匾額,并留詩一首曰:南海蓮花九品香,西方綠竹千年翠。